Uno de los más antiguos de América, el Museo Nacional funciona desde 1823. En 1945 se trasladó a su actual sede "El Panoptico" antes, la penitenciaría más importante del país. El museo alberga la colección de historia natural reunida por Mutis a la que, con el transcurso del tiempo, se sumaron otras de carácter histórico y artístico. En el primer piso se encuentra la Sala de Poblamiento y Sociedades Tempranas, y otras salas de interés antropológico y de exposiciones temporales. El segundo piso está dedicado a la historia colonial y de la independencia, y en el tercer piso se encuentran tres colecciones de arte colombiano, que abarcan desde la época colonial hasta el siglo XX. La sala de arte moderno posee obras de Enrique Grau, Alejandro Obregón y Fernando Botero, entre otros.
Sevicios complementarios: biblioteca, talleres, seminarios, conferencias permanentes, audiovisuales, visitas guiadas bilingues, exposiciones temporales y venta de material especializado.
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